集裝箱單箱體建筑內部功能模塊，依據箱體功能類型的不同而有著不同的模塊選擇方式。在用于住宅的單箱體集裝箱建筑中，功能模塊可供選擇的主要有：廚房模塊，就餐模塊、如廁模塊、沐浴模塊、客廳模塊、臥室模塊、更衣貯藏模塊、工作模塊、以及其他模塊。由于前文所述集裝箱單箱體內不可避免需要布置交通走道，因此每一個模塊的家具部品占有的空間都應盡量緊貼箱體的一側布置，盡可能地讓出剩余空間，以供居者使用或用作通道用途。而使用空間中視覺的需求空間則可以與交通空間產生交集，充分利用此部分空間作為復合空間使用，增加空間利用效率。